Cung Điện Ma Ám kể về Yun Gap là một viên quan trẻ trung và chính trực của triều đại Joseon, bất ngờ bị ám bởi một linh hồn rắn cổ xưa khiến hành vi trở nên kỳ quái. Yeo Ri là cháu gái của một pháp sư nổi tiếng, đồng thời là mối tình đầu của Yun Gap, sở hữu khả năng giao tiếp với linh hồn nhưng luôn muốn sống cuộc sống bình thường. Khi Yun Gap gặp nguy hiểm, Yeo Ri buộc phải tiến cung để giải cứu anh. Cùng với vua Lee Seong, họ khám phá bí mật rùng rợn trong hoàng cung, nơi oan hồn nữ nhi oán hận vẫn chưa được siêu thoát và những âm mưu cổ xưa dần lộ diện.