Đội Thiếu Niên Siêu Đẳng kể về Kim Bong Seok là một học sinh trung học trông bình thường nhưng thực chất cậu có khả năng bay, điều mà cậu thừa hưởng từ cha mẹ mình. Bên cạnh cậu là Jang Hee Soo, cô gái có năng khiếu thể thao xuất chúng và khả năng hồi phục nhanh đến mức có thể đứng dậy sau những chấn thương tưởng chừng chí mạng. Lee Gang Hoon, người bạn còn lại, sở hữu sức mạnh và tốc độ vượt xa giới hạn con người. Cả ba đều học cùng trường và cố gắng giấu kín những năng lực đặc biệt này trong khi cha mẹ họ âm thầm bảo vệ con mình trước những thế lực muốn khai thác sức mạnh ấy cho mục đích riêng.